原子分子工程
计算模拟已经成为化学研究的一个重要手段，这一方面是由于现有的测量手段往往是间接测量，需要理论与计算解释，另一方面则是由于实验条件的限制，理想的实验条件无法真正实现。量子化学计算和分子模拟的手段，可以帮助人们从分子层次上理解化学物质的结构-性能关系，动力学性质和反应特性。
原子与分子工程软件解决方案
通过研究您的专业软件应用程序来构建的服务器硬件解决方案。
涵盖一部分原子分子软件
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ABINT
ABINIT是一个软件套件，可用于计算材料的光学、机械、振动和其他可观察特性的模拟。从密度泛函理论的量子方程开始，可以使用基于DFT的微扰理论和多体格林函数（GW 和 DMFT）建立高级应用程序。 ABINIT可以计算具有任何化学成分的分子、纳米结构和固体，并附带几个完整且强大的原子势表。
GAUSSIAN
GAUSSIAN 是一个量子化学软件包，它是目前应用最广泛的计算化学软件之一，其代码最初由理论化学家、1998年诺贝尔化学奖得主约翰·波普爵士编写，其名称来自于波普在软件中所使用的高斯型基组。使用高斯型基组是波普为简化计算过程缩短计算时间所引入的一项重要近似。
GROMACS
GROMACS 是一种分子动力学应用程序，可以模拟具有数百至数百万个粒子的系统的牛顿运动方程。GROMACS旨在模拟具有许多复杂键合相互作用的生化分子，例如蛋白质，脂质和核酸。
VASP
VASP 全称 Vienna Ab-initio Simulation Package，是维也纳大学 Hafner 小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。
Amber
Amber 是商业分子动力学软件，用于蛋白质、核酸、糖等生物大分子的计算模拟。
LAMMPS
LAMMPS 是大规模原子分子并行计算代码，在原子、分子及介观体系计算中均有重要应用，并行效率高，广泛应用于材料、物理、化学等模拟。
CP2k
CP2K是一个量子化学和固态物理软件包，可以对固态，液态，分子，周期性，材料， 晶体和生物系统进行原子模拟。CP2K可以使用NEB或二聚体方法 进行分子动力学，元动力学，蒙特卡洛，埃伦菲斯特动力学，振动分析，核心能谱， 能量最小化和过渡态优化的模拟。
SIESTA
用于分子和固体的电子结构计算和分子动力学模拟
OpenMPI
OpenMPI是一个免费的、开源的MPI实现，兼容MPI-1和MPI-2标准。OpenMPI由开源社区开发维护，支持大多数类型的HPC平台，并具有很高的性能。
MATLAB
MATLAB是美国MathWorks公司出品的商业数学软件，用于数据分析、无线通信、深度学习、图像处理与计算机视觉、 信号处理、量化金融与风险管理、机器人，控制系统等领域。
Paraview
ParaView是对二维和三维数据进行分析和可视化的程序，它既是一个应用程序框架，也可以直接使用（Turn-Key）。 ParaView支持并行，可以运行于单处理器的工作站，也可以运行于分布式存储器的大型计算机。
QuickPIC
QuickPIC 是基于 UPIC 框架开发的 3D 并行（MPI & OpenMP Hybrid）准静态 PIC 代码。QuickPIC 可以有效地模拟基于等离子体的加速器问题。
GAMESS
GAMESS是一款由Ames研究中心的Mark Gordon开发的开源量子化学软件。GAMESS的功能十分强大，能完成多种类型的计算任务。它支持使用RHF、UHF、ROHF或GVB波函数计算半经验MNDO、AM1或PM3模型；可以进行QM/MM计算，可以处理溶剂效应，很大程度上它可以成为Gaussian的替代品。
DeePMD-kit
DeePMD-kit是一种基于机器学习的分子动力学模拟方法，该方法是通过使用从头计算得到的数据对深度神经网络模型进行训练，从而得到通用的多体势能模型。由于其是基于第一性原理，而具有媲美量子力学的精度。其计算效率高，比第一性原理计算至少快5个数量级。
CHROMA
Chroma是一款格点量子色动力学（LQCD）数值模拟软件包，它是一个为解决夸克和胶子理论而设计的物理应用程序，其属于美国USQCD合作组在美国SciDac经费的支持下开发的USQCD软件集中的子模块。Chroma整合了QCD基本线性代数操作、多线程/进程QCD信息传递、QCD文件IO、稀疏矩阵求解等众多模块。
Osiris
OSIRIS是一个大规模并行计算胞内粒子（PIC）的程序
gnuplot
开源、跨平台数据分析和可视化程序
IntelMPI
英特尔® MPI 库是一个多结构消息传递库
NWChem
量子化学计算软件
Quantum ESPRESSO
Quantum ESPRESSO基于密度泛函理论、平面波和赝势（范数守恒和超软）开发，是用于纳米级电子结构计算和材料建模的开源软件包。
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