利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。生物信息学以各种各样的生物学数据为研究材料,通过计算机处理后再进行结果解读,对生物学数据的搜索、处理及利用。
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涵盖一部分生物信息软件及方法
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AlphaFold2 基于深度神经网络预测蛋白质形态,能够快速生成高精确度的蛋白质 3D 模型。以往花费几周时间预测的蛋白质结构,AlphaFold2 在几小时内就能完成
Augustus是用作de novo基因注释(即从头预测)的软件。
BASIL 是一种从 BAM 格式的对齐配对 HTS 读数中检测结构变体(包括插入断点)断点的方法。
检测病毒整合的软件包
SV检测软件
全基因组甲基化软件
短序列比对软件
序列聚类软件
一个用于聚合产物二次分析的软件包
用于分析下一代测序数据的工具
一种用于发现和表征群体基因组测序数据中拷贝数变异 (CNV) 的工具
AI 蛋白结构预测软件
一种使用下一代测序数据以碱基对分辨率检测基因组结构变异的新算法
使用深度学习识别分类器根据序列和相互作用预测蛋白质功能
开源工具,用深度神经网络从DNA测序数据中快速较精确识别碱基变异位点
二代重测序数据分析软件
C++软件包, 用于模拟粒子在物质中输运的物理过程
mRNA和EST序列的基因组定位和比对程序
序列比对软件
使用双端映射检测结构变异 (SV) 断点
模拟岩浆演化的工具
开源蛋白质结构预测软件
模拟大分子结构的综合软件
医学成像和放射治疗的数值模拟软件
一种集成的结构变异(SV)预测方法
核磁共振、DTI脑成像数据分析软件
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